Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe22Q8C6A8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms