Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms