Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FarsaQ8C0C7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms