Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnrQ8BYI9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnrQ8BYI9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnrQ8BYI9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnrQ8BYI9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnrQ8BYI9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnrQ8BYI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms