Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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