Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms