Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pak4Q8BTW9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pak4Q8BTW9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pak4Q8BTW9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pak4Q8BTW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pak4Q8BTW9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms