Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl3Q8BLF2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl3Q8BLF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms