Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zcchc4Q8BKW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms