Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms