Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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