Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc172Q810N9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms