Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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ChfrQ810L3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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ChfrQ810L3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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