Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a20Q80UJ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a20Q80UJ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms