Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arhgef17Q80U35 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Arhgef17Q80U35 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Arhgef17Q80U35 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Arhgef17Q80U35 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef17Q80U35 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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