Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc42bpbQ7TT50 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms