Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG3

Fbxo5, F-box only protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo5Q7TSG3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo5Q7TSG3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms