Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms