Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stambpl1Q76N33 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms