Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp8b3Q6UQ17 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Atp8b3Q6UQ17 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Atp8b3Q6UQ17 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Atp8b3Q6UQ17 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b3Q6UQ17 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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