Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn2Q6PHP6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms