Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms