Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc3bQ6PDC0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc3bQ6PDC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms