Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms