Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx6Q6P8X1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms