Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms