Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4galnt3Q6L8S8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms