Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms