Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbf1Q6DFZ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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