Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6DFW0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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