Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd1cQ69ZK6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms