Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Git1Q68FF6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms