Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q66JV7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q66JV7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q66JV7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q66JV7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q66JV7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q66JV7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q66JV7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q66JV7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q66JV7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q66JV7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q66JV7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms