Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms