Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms