Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms