Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim28Q62318 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim28Q62318 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim28Q62318 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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