Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms