Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SnrpaQ62189 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpaQ62189 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms