Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3bQ62177 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3bQ62177 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms