Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm38Q62176 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rbm38Q62176 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm38Q62176 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm38Q62176 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm38Q62176 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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