Protein–RNA interactions for Protein: Q61548

Snap91, Clathrin coat assembly protein AP180, mousemouse

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap91Q61548 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap91Q61548 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap91Q61548 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms