Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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