Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf4bQ61136 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms