Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4Q61107 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms