Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms