Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms