Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf4Q60793 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms