Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn2cQ60772 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms