Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms